| 文部科学省 | 国立大学法人等施設整備（文教施設費） | 2015 | 施設整備事業の計画，発注，監理 | 2,922 |
| 文部科学省 | 国立大学法人等施設整備（文教施設費） | 2019 | 施設整備事業の計画、発注、監理 | 2,505 |
| 文部科学省 | 国立大学法人等施設整備（文教施設費） | 2018 | 施設整備事業の計画、発注、監理 | 1,693 |
| 文部科学省 | 国立大学法人等施設整備（文教施設費） | 2017 | 施設整備事業の計画、発注、監理 | 1,323 |
| 内閣府 | 大学等における修学支援に必要な経費 | 2020 | 大学等における修学支援 | 402 |
| 文部科学省 | 国立大学法人における設備等の整備 | 2015 | 大容量・高速医療情報ネットワークシステム 等 | 368 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2016 | - | 245 |
| 文部科学省 | 国立大学改革基盤強化促進事業 | 2015 | 大学院「熱帯水産学」国際連携プログラムのための実習施設の国際基準対応整備 | 176 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2016 | 肉腫への革新的医薬実用化を目指した独自開発の増殖制御型アデノウイルスの医師主導治験 | 170 |
| 文部科学省 | 地（知）の拠点大学による地方創生推進事業 | 2015 | 食と観光で世界を魅了する「かごしま」の地元定着促進プログラム | 105 |
| 厚生労働省 | 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金
（保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 2015 | 施設･設備整備費の支出 | 60 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト） | 2016 | 成人Ｔ細胞白血病・リンパ腫(ATL)に対する新規治療を開発する医師主導治験 | 55 |
| 環境省 | 環境研究総合推進費 | 2016 | ネオニコチノイド系農薬の環境変化対の探索 | 51 |
| 経済産業省 | 太陽光発電のコスト低減に向けた技術開発事業（旧：高性能・高信頼性太陽光発電の発電コスト低減技術開発） | 2015 | ＣＩＳ太陽電池高性能化技術の研究開発（積層構造・改質界面の電子構造評価による電池特性向上技術の開発） | 38 |
| 国土交通省 | 下水道事業 | 2020 | 下水処理場における硝化阻害物質の高効率探索システムの開発 | 30 |
| 経済産業省 | 戦略的次世代バイオマスエネルギー利用技術開発事業 | 2015 | 熱処理とゼオライト触媒反応による高品質バイオ燃料製造プロセスの研究開発 | 29 |
| 経済産業省 | 波力・潮流等の海洋エネルギー発電技術の研究開発事業（旧：海洋エネルギー技術研究開発事業） | 2015 | 性能評価手法及びポテンシャルの調査 | 27 |
| 経済産業省 | 波力・潮流等の海洋エネルギー発電技術の研究開発事業 | 2016 | 性能評価手法及びポテンシャルの調査 | 26 |
| 文部科学省 | 宇宙・航空科学技術推進の調整に必要な経費 | 2020 | 過疎地活性化のための地球観測と高精度測位による放牧地と放牧牛をモニタ可能な自動飼養システムの構築を行う。 | 20 |
| 厚生労働省 | 肝炎患者等支援対策事業費 | 2015 | 肝疾患診療連携拠点病院事業の実施 | 18 |
| 総務省 | IoTの安心・安全かつ適正な利用環境の構築 | 2020 | IoT利用環境の適正な運用及び整備等に資するガイドライン等策定の委託 | 17 |
| 文部科学省 | 専修学校による地域産業中核的人材養成事業 | 2019 | 専修学校における中核的森林管理・林業専門技術者養成プログラムの開発・実証事業 | 12 |
| 文部科学省 | 専修学校による地域産業中核的人材養成事業 | 2020 | 専修学校における中核的森林管理・林業専門技術者養成プログラムの開発・実証事業 | 11 |
| 国土交通省 | 下水道事業 | 2018 | 下水処理水中の生態影響原因物質を対象とした高効率汎用型探索技術の開発 | 10 |
| 国土交通省 | 下水道事業 | 2017 | 下水処理中の生態影響原因物質を対象とした高効率汎用型探索技術の開発 | 10 |
| 国土交通省 | 下水道事業 | 2016 | 下水処理水中の生態影響原因物質を対象とした高効率汎用型探索技術の開発 | 10 |
| 経済産業省 | 次世代電動航空機に関する技術開発事業 | 2020 | 次世代電動推進システム研究開発 | 9 |
| 農林水産省 | 内水面漁業対策 | 2020 | ウナギ種苗の商業化に向けた大量生産技術開発のため、必要な実証試験・研究開発等を行う。 | 9 |
| 文部科学省 | 特別支援教育就学奨励費負担等 | 2018 | 特別支援学校及び小・中学校の特別支援学級等の児童生徒等の保護者等の経済的負担を軽減するために必要な援助を行う。 | 8 |
| 経済産業省 | 太陽光発電の導入可能量拡大等に向けた技術開発事業 | 2020 | 軽量基板上化合物薄膜太陽電池の高効率化技術開発（多様な基板上で実現可能なCIS太陽電池高効率化要素技術の研究開発） | 8 |
| 農林水産省 | 「知」の集積と活用の場によるイノベーション創出推進事業 | 2017 | バイオマス由来の乳酸を用いた新たなバイオマテリアルの開発 | 7 |
| 農林水産省 | 「知」の集積と活用の場による革新的技術創造促進事業 | 2016 | バイオマス由来の乳酸を用いた新たなバイオマテリアルの開発 | 7 |
| 文部科学省 | 専修学校による地域産業中核的人材養成事業 | 2018 | 専修学校における中核的森林管理・林業専門技術者養成プログラムの開発・実証事業 | 7 |
| 農林水産省 | 革新的技術開発・緊急展開事業 | 2016 | 研究機関等による研究ネットワークの形成 | 6 |
| 厚生労働省 | 肝炎総合対策費 | 2016 | 肝炎専門医療従事者の研修事業、一般医療従事者の研修事業、市民公開講座、肝臓病教室の開催等 | 5 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援 | 2020 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 5 |
| 経済産業省 | 次世代電動航空機に関する技術開発事業 | 2019 | 高効率かつ高出力電動推進システムの要素技術開発 | 5 |
| 文部科学省 | 教員資格認定試験 | 2016 | 小学校教員資格認定試験の実施 | 5 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2018 | リモートセンシングによる火山灰放出量の即時把握技術開発 | 4 |
| 厚生労働省 | 肝炎総合対策費 | 2017 | 肝炎専門医療従事者の研修事業、一般医療従事者の研修事業、市民公開講座、肝臓病教室の開催等 | 4 |
| 経済産業省 | プラスチック有効利用高度化事業 | 2020 | 鹿児島近郊での浸漬試験、調査 | 4 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2019 | 東シナ海・南方海域における漂流・海底ごみデータの取得と整理 | 4 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2018 | 東シナ海・南方海域における漂流・海底ごみの調査 | 4 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2017 | 東シナ海・南方海域における漂流・海底ごみデータの取得と整理 | 4 |
| 文部科学省 | 教員資格認定試験 | 2017 | 小学校教員資格認定試験の実施 | 4 |
| 文部科学省 | 教員資格認定試験 | 2015 | 小学校教員資格認定試験の実施 | 4 |
| 厚生労働省 | 看護師の特定行為に係る研修機関支援事業 | 2016 | 研修機関導入促進支援事業の実施 | 4 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2019 | リモートセンシングによる火山灰放出量の即時把握技術開発 | 4 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2017 | リモートセンシングによる火山灰放出量の即時把握技術開発 | 4 |
| 厚生労働省 | 肝炎総合対策費 | 2020 | 肝炎専門医療従事者の研修事業、一般医療従事者の研修事業、市民公開講座、肝臓病教室の開催等 | 4 |
| 厚生労働省 | 肝炎総合対策費 | 2019 | 肝炎専門医療従事者の研修事業、一般医療従事者の研修事業、市民公開講座、肝臓病教室の開催等 | 4 |
| 厚生労働省 | 肝炎総合対策費 | 2018 | 肝炎専門医療従事者の研修事業、一般医療従事者の研修事業、市民公開講座、肝臓病教室の開催等 | 4 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 教育プログラムの構築。受講生募集。 | 4 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 教育プログラムの構築。受講生募集。 | 4 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2017 | 動物プランクトン生産速度と制御機構の調査 | 3 |
| 文部科学省 | 学びによる地域力活性化プログラム普及・啓発事業 | 2015 | 学びを通じた地方創生コンファレンスの開催 | 3 |
| 環境省 | 漂流・漂着・海底ごみに係る削減方策総合検討事業 | 2020 | 東シナ海・南方海域における漂流・海底ごみデータの取得と整理 | 3 |
| 環境省 | セルロースナノファイバー（ＣＮＦ）等の次世代素材活用推進事業(経済産業省・農林水産省連携事業) | 2019 | 評価、分析等 | 3 |
| 環境省 | セルロースナノファイバー（ＣＮＦ）等の次世代素材活用推進事業(経済産業省・農林水産省連携事業) | 2018 | 評価、分析等 | 3 |
| 農林水産省 | 「知」の集積と活用の場による革新的技術創造促進事業 | 2016 | バイオマス熱分解技術による畜産廃棄物等の再資源化・環境対策システムの開発 | 3 |
| 経済産業省 | 波力・潮流等の海洋エネルギー発電技術の研究開発事業 | 2017 | 性能評価手法及びポテンシャルの調査 | 3 |
| 経済産業省 | 化学物質規制対策事業 | 2015 | 反転腸を用いた経口濃縮スクリーニング試験法開発に関する調査 | 3 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2018 | 黒潮域食物網動態機構 | 3 |
| 文部科学省 | 地震防災研究戦略プロジェクト | 2015 | ゲリラ豪雨データベースの構築、土砂災害データベースの構築、桜島大正噴火デジタルアーカイブズの構築、鹿児島県市町村ハザードマップの構築等 | 3 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2018 | 熊本地震を踏まえた活断層の総合調査の共同研究 | 3 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2017 | 熊本地震を踏まえた活断層の総合調査の共同研究 | 3 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2017 | 熊本地震を踏まえた活断層の総合調査の共同研究 | 3 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2020 | リモートセンシングによる火山灰放出量の即時把握技術開発 | 3 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | リモートセンシングによる火山灰放出量の即時把握技術開発 | 3 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2018 | ・クロマグロ等仔稚魚の飼育試験及びサンプルの採取
・メタボローム解析手法の開発 | 3 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2017 | １とグループ提案 | 3 |
| 文部科学省 | 幼児教育の質向上推進プラン | 2018 | 幼児期の教育内容等深化・充実調査研究（幼稚園におけるカリキュラム・マネジメントの効果的な実施に関する調査研究） | 2 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2017 | 黒潮フロント域の栄養塩供給機構の調査 | 2 |
| 文部科学省 | 地震調査研究推進本部 | 2016 | 熊本地震を踏まえた活断層の総合調査の共同研究 | 2 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2020 | 黒潮域食物網動態機構 | 2 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち現場ニーズ対応型研究 | 2019 | 成長の早いスギ等の育苗技術開発 等 | 2 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2019 | 黒潮域食物網動態機構 | 2 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2019 | 地域協働による水環境保全・再生手法検討業務 | 2 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2019 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 2 |
| 経済産業省 | 海洋エネルギー発電技術の早期実用化に向けた研究開発事業 | 2018 | 水中浮遊式海流発電 | 2 |
| 農林水産省 | 「知」の集積と活用の場によるイノベーション創出推進事業 | 2017 | バイオマス熱分解技術による畜産廃棄物等の再資源化・環境対策システムの開発 | 2 |
| 農林水産省 | 戦略的プロジェクト研究推進事業のうち現場ニーズ対応型研究 | 2018 | 成長の早いスギ等の育苗技術開発 等 | 2 |
| 農林水産省 | 農林水産分野における気候変動対応のための研究開発 | 2016 | 新規熱帯・亜熱帯性赤潮情報と養殖履歴情報の収集 | 2 |
| 経済産業省 | 太陽熱エネルギー等活用型住宅の技術開発 | 2015 | 太陽熱活用システムの実証住宅での評価 太陽熱フル活用型住宅の地域適合化に関する研究開発 | 2 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2018 | 黒潮流動構造と栄養塩供給機構 | 2 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2018 | 司法解剖等 | 2 |
| 国土交通省 | 治安及び救難体制の整備に関する経費 | 2017 | 検査委託料 | 2 |
| 文部科学省 | 現職教員の新たな免許状取得を促進する講習等開発事業 | 2015 | 小中学校免許状併有のための講習の開発・実施 | 2 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2015 | 高成長ＤＮＡﾏｰｶｰの開発等 | 2 |
| 文部科学省 | 特別支援教育充実事業 | 2018 | 次期学習指導要領に向けた授業及び教育課程改善研究を実施。 | 2 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2015 | 動物プランクトン生産速度と制御機構の調査 | 2 |
| 文部科学省 | 特別支援教育充実事業 | 2017 | 育成を目指す資質・能力を育むためのカリキュラム・マネジメント実現に関する研究を実施。 | 2 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2016 | １とグループ提案 | 2 |
| 農林水産省 | 内水面漁業対策 | 2018 | ウナギ種苗の商業化に向けた大量生産技術開発のため、必要な実証試験・研究開発等を行う。 | 2 |
| 文部科学省 | 海洋生物資源確保技術高度化 | 2016 | 動物プランクトン生産速度と制御機構の調査 | 2 |
| 内閣府 | 食品健康影響評価技術の研究に必要な経費 | 2019 | 国内で多発するカンピロバクター食中毒の定量的リスク分析に関する研究の分担研究 | 1 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2015 | 1とグループ提案 | 1 |
| 農林水産省 | 農林水産政策研究調査委託費 | 2020 | 有機農産物・食品の輸出拡大とサプライチェーンに関する調査研究 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2020 | 令和2年度世界自然遺産推薦地・奄美大島における環境文化に関するシンポジウム開催補助業務 | 1 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2020 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 1 |
| 国土交通省 | 水資源開発事業 | 2019 | 技術的検討 | 1 |
| 農林水産省 | 農林水産政策研究調査委託費 | 2019 | 有機農産物・食品の輸出拡大とサプライチェーンに関する調査研究 | 1 |
| 環境省 | セルロースナノファイバー（ＣＮＦ）等の次世代素材活用推進事業(経済産業省・農林水産省連携事業) | 2017 | 評価、分析等 | 1 |
| 農林水産省 | 農林水産政策研究調査委託費 | 2018 | 有機農産物・食品の輸出拡大とサプライチェーンに関する調査研究 | 1 |
| 農林水産省 | 漁業資源調査に要する経費 | 2015 | クロマグロの親魚の行動解析 | 1 |
| 農林水産省 | 内水面漁業対策 | 2017 | ウナギ種苗の商業化に向けた大量生産技術開発のため、必要な実証試験・研究開発等を行う。 | 1 |
| 農林水産省 | 内水面漁業対策 | 2016 | ウナギ種苗の商業化に向けた大量生産技術開発のため、必要な実証試験・研究開発等を行う。 | 1 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2018 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 1 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2017 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 1 |
| 経済産業省 | 植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発事業 | 2016 | 高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 | 1 |
| 環境省 | 希少種保護推進費 | 2016 | 奄美大島におけるノネコ対策推進啓発業務 | 1 |
| 国土交通省 | 水資源開発事業 | 2018 | 検討委託 | 1 |
| 内閣府 | 食品健康影響評価技術の研究に必要な経費 | 2018 | 国内で多発するカンピロバクター食中毒の定量的リスク分析に関する研究の分担研究 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2019 | シンポジウム開催補助業務 | 1 |
| 環境省 | 日本の国立公園と世界遺産を活かした地域活性化推進費 | 2017 | 世界自然遺産推薦地・奄美大島におけるシンポジウム開催補助業務 | 1 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2016 | 1とグループ提案 | 1 |
| 文部科学省 | 連携・協働による消費者教育推進事業 | 2015 | 「連携・協働による消費者教育推進事業」における消費者教育推進のための実証的調査研究 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2018 | コンソーシアム構築、教育プログラムの実施・整備 | 1 |
| 文部科学省 | 司書教諭及び学校司書の資質の向上等を通じた学校図書館改革 | 2015 | 司書教諭養成のための講習会の実施 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2020 | 霧島火山における機動観測 | 1 |
| 文部科学省 | 司書教諭及び学校司書の資質の向上等を通じた学校図書館改革 | 2019 | 司書教諭養成のための講習会の実施 | 1 |
| 経済産業省 | 海洋エネルギー発電技術の早期実用化に向けた研究開発事業 | 2019 | 水中浮遊式海流発電 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2017 | 霧島火山における機動観測 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 霧島火山における機動観測 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2016 | 霧島火山における機動観測 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2017 | コンソーシアム構築、教育プログラムの実施・整備 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2019 | 霧島火山における機動観測 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2018 | 霧島火山における機動観測 | 1 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2020 | コンソーシアム構築、教育プログラムの実施・整備 | 0 |
| 国土交通省 | 測量行政推進経費 | 2020 | 令和２年測量士・測量士補試験に伴う会場借り上げ（鹿児島県試験地） | 0 |
| 文部科学省 | 学校図書館総合推進事業 | 2020 | 学校図書館司書教諭講習の実施 | 0 |
| 文部科学省 | 次世代火山研究・人材育成総合プロジェクト | 2019 | コンソーシアム構築、教育プログラムの実施・整備 | 0 |
| 原子力規制委員会 | 大規模噴火のプロセス等の知見整備に係る研究事業 | 2020 | 地下水の採取及び基礎分析作業 | 0 |
| 農林水産省 | 養殖対策 | 2017 | 1とグループ提案 | 0 |
| 経済産業省 | 海洋エネルギー発電技術の早期実用化に向けた研究開発事業 | 2020 | 水中浮遊式海流発電 | 0 |
