| 厚生労働省 | 新型コロナウイルス感染症緊急包括支援等事業 | 2020 | 新型コロナウイルス感染症重点医療機関体制整備事業等に要する経費の補助 | 4,541 |
| 文部科学省 | 先端融合領域イノベーション創出拠点形成プログラム | 2015 | 再生医療本格化のための最先端技術融合拠点 | 507 |
| 文部科学省 | 私立学校教育研究装置等施設整備費補助 | 2019 | 教育基盤の強化や学校施設の防災安全機能強化のための装置及び施設の整備費 | 500 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2017 | スマート治療室 | 438 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2016 | - | 262 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2018 | スマート治療室 | 255 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2015 | スマート治療室 | 240 |
| 国土交通省 | 災害時拠点強靱化緊急促進事業 | 2020 | 災害時拠点強靭化緊急促進事業（災害時拠点病院整備事業） | 227 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2015 | 機能的生体組織製造技術 | 167 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2016 | 小児期発症脊髄性筋萎縮症に対するバルプロ酸ナトリウム多施設共同医師主導治験の実施研究 | 166 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2017 | 機能的生体組織製造技術 | 133 |
| 国土交通省 | 耐震対策緊急促進事業 | 2019 | 耐震対策緊急促進事業 | 124 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2016 | スマート治療室 | 120 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2016 | 機能的生体組織製造技術 | 114 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2016 | 集束超音波治療機器とドラッグデリバリーシステムを組合せた音響力学的療法の実用化開発 | 109 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2018 | 機能的生体組織製造技術 | 97 |
| 厚生労働省 | 医療施設等施設整備費補助金 | 2020 | 医療機関に対する施設整備に係る補助 | 90 |
| 経済産業省 | 先進的医療機器・システム等技術開発事業 | 2019 | 術中の迅速な判断・決定を支援するための診断支援機器・システム開発 | 80 |
| 国土交通省 | 耐震対策緊急促進事業 | 2017 | 耐震対策緊急促進事業 | 71 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2020 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 63 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2020 | 周産期母子医療センター運営事業 | 61 |
| 厚生労働省 | 保健衛生施設等施設・設備整備費補助金
（保健衛生施設等災害復旧費補助金含む） | 2016 | 施設・設備整備費の支出 | 60 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2018 | 救命救急センターの運営 | 47 |
| 厚生労働省 | 医療施設等施設整備費補助金 | 2020 | 医療機関に対する施設整備に係る補助 | 46 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2019 | 救命救急センターの運営 | 44 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（難病克服プロジェクト） | 2016 | ANCA関連血管炎の新規治療薬開発を目指す戦略的シーズ探索と臨床的エビデンス構築研究 | 44 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2017 | 同種歯根膜幹細胞シートの安全性・有効性評価指標の確率と歯周組織の再建 | 43 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2018 | 周産期母子医療センター運営事業 | 43 |
| 文部科学省 | 私立学校施設高度化推進事業費補助 | 2020 | 利子の支払いの一部に充当 | 42 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発） | 2015 | 集束超音波治療機器とドラッグデリバリーシステムを組合せた音響力学的療法の実用化開発 | 41 |
| 厚生労働省 | 医療施設等施設整備費補助金 | 2020 | 医療機関に対する施設整備に係る補助 | 40 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2017 | 救命救急センターの運営 | 38 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2020 | 救命救急センターの運営 | 37 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2015 | 医療機関に対する医療機器等の購入に係る補助 | 37 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2015 | 医療機関に対する医療機器等の購入に係る補助 | 36 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2019 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 34 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2017 | 集束超音波治療機器とドラッグデリバリーシステムを組合せた音響力学的療法の実用化開発 | 32 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2016 | 救命救急センターの運営 | 31 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2018 | 周産期母子医療センター運営事業 | 31 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2018 | 術者の技能に依存しない高度かつ精密な手術システムの開発 | 30 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2015 | 救命救急センターの運営 | 30 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2015 | 周産期母子医療センター運営事業 | 30 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2016 | 周産期母子医療センター運営事業 | 29 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2017 | 周産期母子医療センター運営事業 | 28 |
| 厚生労働省 | 医療・介護サービスの提供体制改革のための基金 | 2019 | 医療機関の施設又は設備の整備 | 26 |
| 経済産業省 | 再生医療・遺伝子治療の産業化に向けた基盤技術開発事業 | 2017 | 体性幹細胞シート製品における迅速品質管理法の開発 | 25 |
| 総務省 | 電波の安全性に関する調査及び評価技術 | 2017 | 無線通信等による電波ばく露の定量的実態把握と脳腫瘍の罹患状況に基づくリスク評価 | 24 |
| 厚生労働省 | 救命救急センター運営事業 | 2017 | 救命救急センターの運営 | 23 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2018 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 22 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2017 | 周産期母子医療センター運営事業 | 21 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2017 | 国産医療機器創出促進基盤整備等事業 | 19 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2018 | 国産医療機器創出促進基盤等整備事業 | 18 |
| 厚生労働省 | 周産期医療体制の確保 | 2016 | 周産期母子医療センター運営事業 | 18 |
| 経済産業省 | 戦略的国際標準化加速事業 | 2018 | 国際標準案の作成・提案等（安全性と医療効率の向上を両立するスマート治療室に関する国際標準化） | 16 |
| 経済産業省 | 戦略的国際標準化加速事業 | 2017 | 国際標準案の作成・提案等（安全性と医療効率の向上を両立するスマート治療室に関する国際標準化） | 16 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2019 | 世界産品創出のために医工融合Finisherを練成する新結合拠点整備事業 | 15 |
| 厚生労働省 | 医療施設の設備整備の支援（統合補助金分） | 2019 | 医療機関に対する医療機器等の導入に係る補助 | 15 |
| 総務省 | 電波の安全性に関する調査及び評価技術 | 2016 | 無線通信等による電波ばく露の定量的実態把握と脳腫瘍の罹患状況に基づくリスク評価 | 15 |
| 総務省 | 電波の安全性に関する調査及び評価技術 | 2019 | 中間周波に係る疫学調査及びばく露量モニタリング調査 | 14 |
| 厚生労働省 | 外国人医師等研修受入推進事業 | 2018 | 医療技術等国際展開推進事業 | 14 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（医療機器・ヘルスケアプロジェクト）(保健衛生医療調査等推進事業費補助金を含む） | 2020 | 世界産品創出のために医工融合Finisherを練成する新結合拠点整備事業 | 10 |
| 文部科学省 | 私立大学等研究設備整備等 | 2018 | 教育基盤設備、研究設備の整備費 | 10 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 日中韓フォーサイト事業（難治性疾患の再生治療におけるナノバイオマテリアルと送達技術戦略） | 9 |
| 厚生労働省 | 医療施設等施設整備費補助金 | 2020 | 医療機関に対する施設整備に係る補助 | 9 |
| 経済産業省 | 戦略的国際標準化加速事業 | 2015 | 国際標準案の作成・提案等 | 9 |
| 経済産業省 | 戦略的国際標準化加速事業 | 2015 | 国際標準案の作成・提案等 | 9 |
| 厚生労働省 | ＮＩＣＵ等からの退院の促進 | 2017 | NICU等に長期入院している小児の在宅への移行事業等 | 9 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2017 | 日中韓フォーサイト事業（難治性疾患の再生治療におけるナノバイオマテリアルと送達技術戦略） | 9 |
| 文部科学省 | 独立行政法人日本学術振興会運営費交付金に必要な経費 | 2016 | 日中韓フォーサイト事業（難治性疾患の再生治療におけるナノバイオマテリアルと送達技術戦略） | 8 |
| 経済産業省 | 先進的医療機器・システム等技術開発事業 | 2019 | 基盤技術開発プロジェクト | 7 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発プロジェクト） | 2016 | 国産医療機器創出促進基盤整備等事業 | 7 |
| 厚生労働省 | 医療研究開発推進事業費補助金（オールジャパンでの医療機器開発） | 2015 | 国産医療機器創出促進基盤整備等事業 | 7 |
| 総務省 | 電波の安全性に関する調査及び評価技術 | 2018 | 中間周波に係る疫学調査及びばく露量モニタリング調査 | 6 |
| 環境省 | 石綿問題への緊急対応に必要な経費 | 2018 | 石綿関連疾患に係る医学的所見の解析調査業務（新たな免疫染色抗体を用いた中皮腫診断法の開発に関する調査編） | 6 |
| 農林水産省 | ムーンショット型農林水産研究開発事業 | 2020 | ムーンショット目標5の実現に向けた研究開発の推進 | 5 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2019 | 糖尿病対策・脳卒中対策・周産期医療に係る医療関係者による検討会等の開催 | 5 |
| 環境省 | 石綿問題への緊急対応に必要な経費 | 2016 | 石綿関連疾患に係る医学的所見の解析調査業務（FISH法等を用いた中皮腫診断法の開発に関する調査編） | 5 |
| 環境省 | 石綿問題への緊急対応に必要な経費 | 2015 | 石綿関連疾患に係る医学的所見の解析調査業務（FISH法を用いた中皮腫診断法の開発に関する調査編） | 5 |
| 厚生労働省 | 女性医師キャリア支援モデル普及推進事業 | 2016 | 地域の医療機関で普及可能な女性医師支援の「効果的支援策モデル」の作成及び普及推進の実施 | 5 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2018 | 糖尿病対策・脳卒中対策・周産期医療に係る医療関係者による検討会等の開催 | 5 |
| 環境省 | 石綿問題への緊急対応に必要な経費 | 2017 | 石綿関連疾患に係る医学的所見の解析調査業務（新たな免疫染色抗体を用いた中皮腫診断法の開発に関する調査編） | 4 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2017 | 周産期医療に係る医療関
係者による検討会等の開催 | 4 |
| 厚生労働省 | 医療技術の費用対効果を評価するために必要な経費 | 2017 | 再分析業務 | 4 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2020 | 周産期医療に係る医療関係者による検討会等の開催 | 3 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2019 | 医師派遣等業務 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2019 | 糖尿病対策・脳卒中対策に係る医療関係者による検討会等の開催 | 3 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2018 | 医師派遣等業務 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2018 | 糖尿病対策・脳卒中対策に係る医療関係者による検討会等の開催 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2017 | 周産期医療に係る医療関
係者による検討会等の開催 | 3 |
| 厚生労働省 | 医療連携体制推進事業 | 2020 | 周産期医療に係る医療関係者による検討会等の開催 | 2 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2019 | 医師派遣等業務 | 2 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2019 | 医師派遣等業務 | 2 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2019 | 医師派遣等業務 | 2 |
| 総務省 | 電波の安全性に関する調査及び評価技術 | 2017 | 中間周波に係る疫学調査及びばく露量モニタリング調査 | 2 |
| 経済産業省 | 国際研究開発・実証プロジェクト | 2015 | 現地国事情に適した高品位透析治療を達成する透析水清浄化システムの研究開発・実証 | 2 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2018 | 医師派遣等業務 | 2 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2018 | 医師派遣等業務 | 2 |
| 厚生労働省 | 専門医認定支援事業 | 2018 | 医師派遣等業務 | 2 |
| 経済産業省 | 国際研究開発・実証プロジェクト | 2016 | 現地国事情に適した高品位透析治療を達成する透析水清浄化システムの研究開発 | 1 |
| 経済産業省 | 未来医療を実現する医療機器・システム研究開発事業 | 2018 | 臨床現場の医師の暗黙知を利用する医療機器開発システム～「メディカル・デジタル・テストベッド」の構築～ | 1 |
| 厚生労働省 | 災害時における医療提供体制の確保 | 2018 | 防災訓練等参加支援事業 | 1 |
| 総務省 | 戦略的情報通信研究開発推進事業 | 2018 | 合併症予測型脳神経外科手術用ナビゲーションシステムと術中情報共有システムに関する研究開発 | 0 |
