| 防衛省 | 潜水艦救難艦（ＡＳＲ） | 2017 | 潜水艦救難艦の建造 | 19,711 |
| 防衛省 | 潜水艦救難艦（ＡＳＲ） | 2015 | 潜水艦救難艦の建造。 | 7,722 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2016 | 大型巡視船（3,500トン型）１隻建造 | 4,620 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2017 | 【歳出化】護衛艦定期検査等 | 4,062 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2016 | 大型測量船１隻建造 | 4,050 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2016 | 【歳出化】護衛艦定期検査等 | 3,659 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2015 | 1,000トン型巡視船建造 | 3,384 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2017 | 【歳出】護衛艦定期検査等 | 2,343 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2015 | 自衛艦の定年検等 | 2,043 |
| 防衛省 | 潜水艦救難艦（ＡＳＲ） | 2016 | 潜水艦救難艦の建造 | 1,839 |
| 防衛省 | 潜水艦救難艦（ＡＳＲ） | 2016 | 主機械の製造 | 1,730 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2015 | 自衛艦の定年検等 | 1,724 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2016 | 【歳出】護衛艦定期検査等 | 1,443 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2016 | １，０００トン型巡視船１隻建造 | 912 |
| 防衛省 | 通信機器購入費(海自) | 2015 | 護衛艦「さざなみ」衛星通信装置 他９件 | 509 |
| 経済産業省 | 洋上風力発電等のコスト低減に向けた研究開発事業（旧：洋上風力発電等技術研究開発） | 2015 | 次世代浮体式洋上風力発電システム実証研究（セミサブ型） | 494 |
| 防衛省 | 潜水艦救難艦（ＡＳＲ） | 2015 | 主機械の製造 | 398 |
| 防衛省 | 通信機器購入費（海自） | 2017 | Ｘバンド衛星通信の再構築（艦艇） 他９件 | 315 |
| 防衛省 | 潜水艦救難態勢の維持 | 2016 | ＤＤＣ圧力・環境自動制御装置
構成品等の換装 | 287 |
| 防衛省 | 弾薬（海上自衛隊） | 2018 | 自走式機雷処分用弾薬 | 277 |
| 防衛省 | 弾薬（海上自衛隊） | 2016 | 自走式機雷処分用弾薬 | 235 |
| 環境省 | CO2排出削減対策強化誘導型技術開発・実証事業 | 2016 | 沿岸域における次世代型波力発電システムの技術開発・実証事業 | 211 |
| 国土交通省 | (国研）海上・港湾・航空技術研究所施設整備費補助金 | 2015 | 多方向不規則波造波装置制御装置改良工事 | 189 |
| 環境省 | CO2排出削減対策強化誘導型技術開発・実証事業 | 2015 | 小型で高効率な波力発電システムに関わる技術開発・実証事業（副題：大洗港における技術実証） | 173 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2015 | 艦橋情報表示装置用構成品等 | 170 |
| 防衛省 | 艦船修理費(海自) | 2015 | 艦橋情報表示装置用構成品等 | 170 |
| 復興庁 | 浮体式洋上ウィンドファーム実証研究事業 | 2015 | 2MW浮体式洋上風車の運転データ取得及び維持管理等 | 164 |
| 防衛省 | 掃海艇（ＭＳＣ） | 2015 | 自走式機雷処分用弾薬管制装置の製造 | 156 |
| 経済産業省 | メタンハイドレート開発促進事業委託費 | 2015 | 抗井内流動の実験的解析と抗底圧制御技術の開発 | 130 |
| 防衛省 | 掃海艇（ＭＳＣ） | 2016 | 自走式機雷処分用弾薬管制装置の製造 | 121 |
| 防衛省 | 掃海艇（ＭＳＣ） | 2017 | 自走式機雷処分用弾薬の製造 | 121 |
| 防衛省 | 掃海艇（ＭＳＣ） | 2016 | 自走式機雷処分用弾薬の製造 | 121 |
| 国土交通省 | 土木関連施設整備費、建築関連施設整備費 | 2015 | 海岸平面造波施設改修工事 | 119 |
| 防衛省 | 弾薬（海上自衛隊） | 2017 | 自走式機雷処分用弾薬 | 115 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2017 | 2MW風車（浮体）保守・管理 | 112 |
| 経済産業省 | 波力・潮流等の海洋エネルギー発電技術の研究開発事業 | 2017 | 機械式波力発電 | 109 |
| 経済産業省 | 波力・潮流等の海洋エネルギー発電技術の研究開発事業 | 2016 | 機械式波力発電 | 92 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2018 | 2MW風車（浮体）保守・管理 | 85 |
| 防衛省 | 音響測定艦（ＡＯＳ） | 2017 | 音響測定艦の建造 | 76 |
| 防衛省 | ソーナー用ラバーウィンドウの整備 | 2015 | ラバーウィンドウ換装 | 73 |
| 経済産業省 | メタンハイドレート開発促進事業委託費 | 2016 | 坑井内流動の実験的解析と坑底圧制御技術の開発 | 51 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構設備費補助 | 2015 | 地球深部探査船「ちきゅう」で使用しているADDエンジンの安全性を向上させるために必要な換装部品の購入 | 48 |
| 防衛省 | 通信機器購入費(海自) | 2016 | 「ひびき」システム改修（造船所工事） 他６件 | 44 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人土木研究所（施設整備費） | 2017 | 風洞装置付２次元造波水路改造その他工事 | 44 |
| 経済産業省 | 国内石油天然ガスに係る地質調査・メタンハイドレートの研究開発等事業 | 2017 | 坑井内流動の実験的解析と坑底圧制御技術の開発 | 37 |
| 文部科学省 | 放射性廃棄物減容化研究開発の推進 | 2017 | 遠隔交換治具及びハンドリング装置の製作 | 32 |
| 防衛省 | 通信機器購入費(海自) | 2015 | 輸送艦「おおすみ」年次検査（造船所工事） 他８件 | 31 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的育成のための総合対策（海洋資源開発関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2016 | 次世代船体位置保持技術の開発 | 29 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2015 | 環境に優しい機関システムの開発 | 28 |
| 経済産業省 | 国内石油天然ガスに係る地質調査・メタンハイドレートの研究開発等委託費
国内石油天然ガスに係る地質調査事業費補助金 | 2018 | 表層型メタンハイドレートを対象とした減圧・加熱併用法に関する調査・検討 | 27 |
| 防衛省 | 自給式呼吸器（ＳＣＢＡ）用吸気充填機等の装備 | 2016 | 充填機等の装備役務の請負 | 25 |
| 経済産業省 | 福島沖での浮体式洋上風力発電システムの実証研究事業委託費 | 2016 | 2MW風車保守・管理 | 25 |
| 国土交通省 | 国際物流競争力強化に対応した情報ネットワーク構築等経費 | 2017 | 平成29年度コンテナ物流情報サービス（Colins）保守・運用業務 | 25 |
| 国土交通省 | 国際物流競争力強化に対応した情報ネットワーク構築等経費 | 2016 | 平成28年度コンテナ物流情報サービス（Colins）保守・運用業務 | 25 |
| 国土交通省 | 国際物流競争力強化に対応した情報ネットワーク構築等経費 | 2015 | 平成27年度コンテナ物流情報サービス（Colins）保守・運用業務 | 24 |
| 防衛省 | 掃海艇（ＭＳＣ） | 2016 | 自走式機雷処分用弾薬（初度費） | 21 |
| 厚生労働省 | 特定有害業務従事者の離職者特殊健康診断実施事業 | 2019 | 健康診断の実施 | 20 |
| 厚生労働省 | 特定有害業務従事者の離職者特殊健康診断実施事業 | 2015 | 健康診断の実施 | 20 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2016 | 船舶主機排熱利用VPCシステムの実証 | 19 |
| 厚生労働省 | 特定有害業務従事者の離職者特殊健康診断実施事業 | 2016 | 健康診断の実施 | 19 |
| 経済産業省 | 国内石油天然ガスに係る地質調査・メタンハイドレートの研究開発等事業 | 2017 | 表層型メタンハイドレート回収技術開発に関わる調査研究（広範囲鉛直掘削法による表層型メタンハイドレート回収の基礎的検討） | 17 |
| 復興庁 | 国立研究開発法人科学技術振興機構運営費交付金に必要な経費 | 2015 | 海底土放射能分布測定ロボットの開発 | 16 |
| 国土交通省 | 国際物流競争力強化に対応した情報ネットワーク構築等経費 | 2018 | コンテナ物流情報サービス（Colins）保守・運用業務 | 16 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2015 | 船舶主機排熱利用VPCシステムの実証 | 14 |
| 経済産業省 | 波力・潮流等の海洋エネルギー発電技術の研究開発事業（旧：海洋エネルギー技術研究開発事業） | 2015 | 機械式波力発電 | 12 |
| 経済産業省 | メタンハイドレート開発促進事業委託費 | 2016 | 表層型メタンハイドレート回収技術開発に関わる調査研究(広範囲鉛直掘削法による表層型メタンハイドレート回収の基礎的検討) | 12 |
| 文部科学省 | 国立研究開発法人日本原子力研究開発機構施設整備費 | 2015 | 大洗固体廃棄物減容処理施設のスリーブ及びプラグの製作 | 12 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2016 | 環境に優しい機関システムの開発 | 11 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2015 | 高度航海システムの研究開発 | 11 |
| 国土交通省 | 国際物流競争力強化に対応した情報ネットワーク構築等経費 | 2016 | 平成28年度国際物流効率化のためのColinsシステム及びNEAL-NETシステム改修業務 | 10 |
| 国土交通省 | 国際戦略港湾コンテナターミナル高度化実証事業 | 2018 | コンテナ物流情報サービス（Colins）保守・運用業務 | 9 |
| 国土交通省 | 国際戦略港湾コンテナターミナル高度化実証事業 | 2017 | 国際物流効率化のためのColinsシステム改修業務 | 8 |
| 国土交通省 | 巡視船艇の整備に関する経費 | 2016 | 艤装員待機施設提供 | 7 |
| 国土交通省 | 国際戦略港湾コンテナターミナル高度化実証事業 | 2016 | 情報技術を活用した内航フィーダーコンテナの積付効率化検討業務 | 7 |
| 防衛省 | 高性能２０ｍｍ機関砲（ＣＩＷＳ ＭＫ１５）のオーバーホール等 | 2015 | 高性能２０ｍｍ機関砲換装の役務 | 6 |
| 防衛省 | 潜水艦救難態勢の維持 | 2017 | 水中昇降室ＰＴＣアンビリカルの換装 | 6 |
| 文部科学省 | 放射性廃棄物減容化研究開発の推進 | 2016 | ADSターゲット試験施設鉛ビスマス配管の遠隔交換化に関わる遠隔溶接検証試験 | 6 |
| 文部科学省 | 放射性廃棄物減容化研究開発の推進 | 2017 | ADSターゲット試験施設遠隔配管交換装置 概念設計 | 4 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2016 | 舶用大型ディーゼル機関のEGR装置によるCO2及びNOx削減技術の実証 | 4 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所運営費交付金 | 2016 | 研究設備保守等 | 3 |
| 国土交通省 | 海洋産業の戦略的振興のための総合対策（次世代海洋環境関連技術研究開発費補助金関係経費） | 2016 | 環境に優しい機関システムの開発 | 2 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所運営費交付金 | 2016 | 研究設備保守等 | 2 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所運営費交付金 | 2016 | 研究設備保守等 | 2 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所運営費交付金 | 2016 | 研究設備保守等 | 2 |
| 経済産業省 | 海洋鉱物資源開発に向けた資源量評価・生産技術等調査事業委託費 | 2019 | 試験設備装置の設計 | 1 |
| 国土交通省 | 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所運営費交付金 | 2016 | 研究設備保守等 | 1 |
| 国土交通省 | 船舶の安全確保、海洋汚染の防止等に必要な経費 | 2016 | 船舶検査官に対する安全体感に係る研修業務 | 0 |
| 国土交通省 | 船舶の安全確保、海洋汚染の防止等に必要な経費 | 2015 | 船舶検査官に対する安全体感研修 | 0 |
