| 環境省 | 大規模災害に備えた廃棄物処理体制検討・拠点整備事業 | 2015 | 高効率ごみ発電施設 | 1,395 |
| 農林水産省 | 水産基盤整備事業（補助） | 2018 | 市町村が実施する水産基盤整備事業に要する経費 | 315 |
| 環境省 | 再エネ等を活用した水素社会推進事業 | 2017 | 副生水素の広域輸送による、水素利用検討（共同実施） | 82 |
| 農林水産省 | 農山漁村地域整備交付金 | 2019 | 農山漁村地域地域の総合的な整備（海岸保全施設整備事業） | 76 |
| 環境省 | 再エネ等を活用した水素社会推進事業 | 2019 | 副生水素の広域輸送による、水素利用検討（共同実施） | 60 |
| 環境省 | 再エネ等を活用した水素社会推進事業 | 2018 | 副生水素の広域輸送による、水素利用検討（共同実施） | 54 |
| 総務省 | 「地域経済循環の創造」の推進に要する経費 | 2016 | 地域経済循環創造事業交付金 | 49 |
| 環境省 | 再エネ等を活用した水素社会推進事業 | 2017 | 副生水素の広域輸送による、水素利用検討（共同実施） | 48 |
| 農林水産省 | 森林整備事業（補助） | 2015 | 市町村営事業による森林整備等の実施 | 38 |
| 総務省 | 無線システム普及支援事業（携帯電話等エリア整備事業） | 2020 | 携帯電話用基地局施設整備事業 | 35 |
| 環境省 | 脱炭素社会構築に向けた再エネ等由来水素活用推進事業（一部経済産業省、国土交通省連携事業） | 2020 | 副生水素の広域輸送による、水素利用検討（共同実施） | 25 |
| 消費者庁 | 地方消費者行政のための事業に必要な経費 | 2018 | 地方消費者行政強化交付金の交付 | 13 |
| 内閣府 | 民間資金等活用事業調査等に必要な経費 | 2020 | 民間資金等活用事業調査費補助事業 | 9 |
| 国土交通省 | 集約都市形成支援事業 | 2018 | 集約都市形成支援事業 | 5 |
| 国土交通省 | 国際クルーズ旅客受入機能高度化事業 | 2017 | 下関港国際クルーズ旅客受入機能高度化事業 | 4 |
| 厚生労働省 | 高齢者医療制度円滑運営事業費補助金 | 2020 | 高齢者医療制度の円滑な運営のための体制整備事業 | 2 |
| 厚生労働省 | 介護報酬改定等に伴うシステム改修経費 | 2016 | 介護報酬改定等に伴うシステム改修経費等 | 2 |
| 厚生労働省 | 肝炎患者等支援対策事業費 | 2017 | 肝炎対策協議会の開催、普及啓発事業、肝疾患診療連携拠点病院事業の実施 | 1 |
| 農林水産省 | 水産多面的機能発揮対策 | 2020 | 事務の適切な実施を図るために必要な指導等の事務 | 0 |
| 文部科学省 | 地域とともにある学校づくりの推進 | 2015 | 自律的・組織的な学校運営体制の構築に向けた調査研究 | 0 |
| 厚生労働省 | 肝炎患者等支援対策事業費 | 2019 | 肝炎対策協議会の開催、普及啓発事業、肝疾患診療連携拠点病院事業の実施 | 0 |
| 厚生労働省 | 肝炎患者等支援対策事業費 | 2020 | 肝炎対策協議会の開催、普及啓発事業、肝疾患診療連携拠点病院事業（肝疾患相談・支援センターの設置、運営等）の実施 | 0 |
| 文部科学省 | 高校生等への修学支援 | 2017 | 市町村が設置する公立学校の教育に必要な経費を交付・支出 | 0 |
